Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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P20040 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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P20040 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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P20040 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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P20040 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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P20040 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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P20040 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P20040 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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