Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Gm2035J3QP87 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
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