Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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