Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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