Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Mir124-2hg-204ENSMUST00000188983 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 4930430E12Rik-201ENSMUST00000139214 901 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Arhgap6-202ENSMUST00000087016 1310 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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