Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Rsrc1-201ENSMUST00000046542 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm37389-201ENSMUST00000194885 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Traf7-215ENSMUST00000176652 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Eno4-201ENSMUST00000054280 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Rorc-201ENSMUST00000029795 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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