Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms