Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms