Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cwc22Q8C5N3 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms