Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

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Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp40Q8BWR4 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp40Q8BWR4 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp40Q8BWR4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp40Q8BWR4 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp40Q8BWR4 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp40Q8BWR4 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp40Q8BWR4 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp40Q8BWR4 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp40Q8BWR4 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Usp40Q8BWR4 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Usp40Q8BWR4 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Usp40Q8BWR4 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Usp40Q8BWR4 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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