Protein–RNA interactions for Protein: Q60769

Tnfaip3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, mousemouse

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Length 775 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip3Q60769 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Tnfaip3Q60769 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfaip3Q60769 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfaip3Q60769 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfaip3Q60769 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfaip3Q60769 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfaip3Q60769 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfaip3Q60769 Tmem260-202ENSMUST00000124720 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfaip3Q60769 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfaip3Q60769 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfaip3Q60769 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfaip3Q60769 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfaip3Q60769 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfaip3Q60769 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Tnfaip3Q60769 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Tnfaip3Q60769 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Tnfaip3Q60769 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tnfaip3Q60769 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tnfaip3Q60769 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tnfaip3Q60769 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tnfaip3Q60769 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfaip3Q60769 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms