Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Sgo2b-201ENSMUST00000179944 3739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Xpo5-201ENSMUST00000087031 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp15-201ENSMUST00000084527 4264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Wiz-203ENSMUST00000087703 4175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 D3Ertd751e-201ENSMUST00000026867 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb43-201ENSMUST00000028125 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm45769-201ENSMUST00000204588 1828 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb34-202ENSMUST00000113158 6602 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Lonp2-203ENSMUST00000122188 2372 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Sipa1l1-205ENSMUST00000220963 5907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Cd300a-202ENSMUST00000106582 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Pde1c-204ENSMUST00000164752 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Serpina3m-201ENSMUST00000101078 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Serpina3m-202ENSMUST00000168797 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Pex5-203ENSMUST00000112530 3051 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm10629-201ENSMUST00000137706 2014 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm37039-201ENSMUST00000193733 2485 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 B3gntl1-202ENSMUST00000067399 2864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Adora3-201ENSMUST00000000574 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a9-202ENSMUST00000118383 1869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 1700010I14Rik-203ENSMUST00000151609 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Evc-203ENSMUST00000114154 3695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Fes-208ENSMUST00000206728 2707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 C7-201ENSMUST00000110689 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef10l-204ENSMUST00000105797 3507 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Tigd4-201ENSMUST00000062623 3459 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Taok3-210ENSMUST00000179276 4302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms