Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms