Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U6N9 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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