Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Olfr578-201ENSMUST00000056235 942 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm9117-201ENSMUST00000177735 1098 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm43122-202ENSMUST00000202259 526 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm32098-201ENSMUST00000211305 479 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gimd1-205ENSMUST00000212852 1234 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms