Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms