Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Gm28462-201ENSMUST00000185217 374 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Gm28406-201ENSMUST00000186516 397 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Gm28348-201ENSMUST00000187833 397 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Gm29404-201ENSMUST00000187914 397 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Gm29003-202ENSMUST00000190434 453 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Gm28313-201ENSMUST00000191411 397 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Gm35670-201ENSMUST00000192493 397 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Gm37656-201ENSMUST00000192673 397 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Ighv5-10-201ENSMUST00000194591 252 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Gm37561-201ENSMUST00000195221 368 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 AC124555.1-201ENSMUST00000227051 880 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Cxcr1-201ENSMUST00000053389 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Cenph-201ENSMUST00000075550 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Gm26205-201ENSMUST00000082907 134 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Nhlh1Q02576 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Nhlh1Q02576 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Nhlh1Q02576 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Nhlh1Q02576 Cd74-203ENSMUST00000167610 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Nhlh1Q02576 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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