Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 2610017A05Rik-201ENSMUST00000204670 1661 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Olfr1350-203ENSMUST00000219278 1768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Ms4a6c-201ENSMUST00000165310 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 A730018C14Rik-201ENSMUST00000050754 2253 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm13844-201ENSMUST00000134541 581 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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VdrP48281 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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VdrP48281 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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VdrP48281 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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VdrP48281 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Fam32a-201ENSMUST00000003123 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Olfr221-204ENSMUST00000216188 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VdrP48281 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms