Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sept4P28661 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sept4P28661 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sept4P28661 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sept4P28661 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sept4P28661 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sept4P28661 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sept4P28661 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sept4P28661 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sept4P28661 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sept4P28661 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sept4P28661 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sept4P28661 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sept4P28661 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sept4P28661 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sept4P28661 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sept4P28661 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sept4P28661 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sept4P28661 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sept4P28661 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sept4P28661 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sept4P28661 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sept4P28661 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms