Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms