Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Baiap3-201ENSMUST00000169109 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Knstrn-206ENSMUST00000134661 4602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Trmt13-201ENSMUST00000041524 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Pard3b-201ENSMUST00000046673 3426 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Filip1-201ENSMUST00000093811 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm8314-201ENSMUST00000208964 1858 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Spocd1-201ENSMUST00000084263 3096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Pde4b-201ENSMUST00000030251 1923 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Fmn1-203ENSMUST00000102547 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm16059-201ENSMUST00000135583 3778 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Cdh23-204ENSMUST00000105463 10991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm12592-201ENSMUST00000155332 2954 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Wdr89-202ENSMUST00000187307 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gpr68-203ENSMUST00000110066 3223 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Myo18a-209ENSMUST00000108376 7374 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 4930552P12Rik-201ENSMUST00000181198 2496 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Fam149b-210ENSMUST00000224721 4483 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms