Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms