Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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PtprfA2A8L5 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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