Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm37963-201ENSMUST00000195351 613 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Olfr46-202ENSMUST00000211771 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Cenpk-202ENSMUST00000070761 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Plgrkt-208ENSMUST00000143467 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms