Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr55Q9CX97 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms