Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm45769-201ENSMUST00000204588 1828 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm45289-201ENSMUST00000211048 2577 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrrdQ8K2M3 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms