Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkciQ62074 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkciQ62074 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms