Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Miga2-202ENSMUST00000100214 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Prmt7-201ENSMUST00000071592 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Skap2Q3UND0 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms