Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fbxw18Q3TSA9 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fbxw18Q3TSA9 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fbxw18Q3TSA9 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fbxw18Q3TSA9 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fbxw18Q3TSA9 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fbxw18Q3TSA9 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms