Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atp2b3Q0VF55 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Atp2b3Q0VF55 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Atp2b3Q0VF55 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Atp2b3Q0VF55 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Atp2b3Q0VF55 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atp2b3Q0VF55 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atp2b3Q0VF55 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atp2b3Q0VF55 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms