Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 P2rx7-201ENSMUST00000031425 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm3532-201ENSMUST00000181880 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm26810-201ENSMUST00000181153 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 AC156274.1-201ENSMUST00000219193 634 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 CT025547.1-201ENSMUST00000225127 578 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Tph1-202ENSMUST00000107669 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm36948-201ENSMUST00000194708 3247 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Eif4a-ps4-201ENSMUST00000122226 1218 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Cryab-206ENSMUST00000217475 1117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Crip1-201ENSMUST00000006523 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Fhl1-206ENSMUST00000116596 1203 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm13629-201ENSMUST00000141149 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm9273-201ENSMUST00000200606 715 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Pf4-203ENSMUST00000202625 411 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm7924-201ENSMUST00000203975 785 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm44664-201ENSMUST00000206841 1786 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm15383-201ENSMUST00000121889 1443 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms