Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms