Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm33037-201ENSMUST00000217927 642 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Mettl21c-201ENSMUST00000061421 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Rps25-201ENSMUST00000080300 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Dnm3-205ENSMUST00000160665 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm18901-201ENSMUST00000197840 1444 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Rhox3e-202ENSMUST00000115198 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm22906-201ENSMUST00000175191 250 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lhx8O35652 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
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