Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms