Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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