Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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