Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Entpd8-202ENSMUST00000114376 1942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Ttll7-203ENSMUST00000106134 2664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm33180-201ENSMUST00000217109 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm13631-201ENSMUST00000140978 654 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm23820-201ENSMUST00000158450 300 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Mir6354-201ENSMUST00000184979 116 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm7160-201ENSMUST00000185535 471 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm38153-201ENSMUST00000195484 472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Cox7a1-201ENSMUST00000098594 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Zfp819-202ENSMUST00000116324 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Rsrc2-208ENSMUST00000182309 1595 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Add2-201ENSMUST00000032069 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm12452-201ENSMUST00000117128 331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm12188-201ENSMUST00000117387 310 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm37012-201ENSMUST00000194991 1078 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm44978-201ENSMUST00000206635 317 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm19121-201ENSMUST00000215720 1022 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gzmb-201ENSMUST00000015581 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Depdc1b-205ENSMUST00000171178 1404 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gtf2f2-201ENSMUST00000088922 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Igkv4-55-201ENSMUST00000103359 379 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm11546-201ENSMUST00000120297 354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm16118-201ENSMUST00000161914 680 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Kcne3-204ENSMUST00000179842 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Tmem89-202ENSMUST00000192852 945 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm44767-201ENSMUST00000206634 469 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm32567-201ENSMUST00000211244 682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 CT030664.1-201ENSMUST00000223639 908 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Apom-201ENSMUST00000025249 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Ptprr-207ENSMUST00000155606 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Tmx2-202ENSMUST00000111664 1926 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Ighv6-3-201ENSMUST00000103486 356 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Ighv6-6-201ENSMUST00000103489 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm12168-201ENSMUST00000119051 368 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Mrgpra2b-201ENSMUST00000119798 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm13472-201ENSMUST00000120948 314 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm13713-201ENSMUST00000139377 703 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm14437-201ENSMUST00000152284 360 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm13713-202ENSMUST00000155472 285 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Ube2i-214ENSMUST00000174216 1144 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 5730420D15Rik-201ENSMUST00000181781 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 E130114P18Rik-209ENSMUST00000186369 306 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm36973-201ENSMUST00000193942 259 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 AC167234.1-201ENSMUST00000219929 279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Grxcr2-201ENSMUST00000097591 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms