Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Lgr5Q9Z1P4 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Lgr5Q9Z1P4 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Lgr5Q9Z1P4 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lgr5Q9Z1P4 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Lgr5Q9Z1P4 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Lgr5Q9Z1P4 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Lgr5Q9Z1P4 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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