Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Usp49Q6P9L4 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Usp49Q6P9L4 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Usp49Q6P9L4 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Usp49Q6P9L4 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Usp49Q6P9L4 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Usp49Q6P9L4 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Usp49Q6P9L4 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Usp49Q6P9L4 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Usp49Q6P9L4 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Usp49Q6P9L4 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Usp49Q6P9L4 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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