Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 CT025547.1-201ENSMUST00000225127 578 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Ube2l3-203ENSMUST00000115700 571 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm12420-201ENSMUST00000119869 1048 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm30652-201ENSMUST00000199103 430 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm9273-201ENSMUST00000200606 715 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm7812-201ENSMUST00000203479 874 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm5072-201ENSMUST00000063726 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm16499-201ENSMUST00000204648 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm38220-201ENSMUST00000195774 1447 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Ighv14-3-201ENSMUST00000103469 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms