Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

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Length 1,197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Zbtb38Q3LR78 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb38Q3LR78 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb38Q3LR78 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb38Q3LR78 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbtb38Q3LR78 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Zbtb38Q3LR78 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Zbtb38Q3LR78 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Zbtb38Q3LR78 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Zbtb38Q3LR78 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Zbtb38Q3LR78 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Zbtb38Q3LR78 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Zbtb38Q3LR78 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Zbtb38Q3LR78 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Zbtb38Q3LR78 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Sh2d1a-207ENSMUST00000189753 1223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms