Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms