Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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SrprbP47758 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms