Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csnk2a2O54833 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms