Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf4E9QAP7 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms