Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm12792-201ENSMUST00000117669 1019 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm26706-201ENSMUST00000180718 746 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Pantr1-211ENSMUST00000186656 647 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Smgc-204ENSMUST00000109277 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms