Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rabgef1Q9JM13 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rabgef1Q9JM13 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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