Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl4Q9DCU6 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms