Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Nfia-203ENSMUST00000092532 9382 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Pop5Q9DB28 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Pop5Q9DB28 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Pop5Q9DB28 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Pop5Q9DB28 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Pop5Q9DB28 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Pop5Q9DB28 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Pop5Q9DB28 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Pop5Q9DB28 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Pop5Q9DB28 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
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Pop5Q9DB28 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms