Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms